Η πρώτη μεγάλη προπονητική εμπειρία του Εμρέ ξεκινά στην Μπασακσεχίρ. Η τούρκικη ομάδα ανακοίνωσε την πρόσληψη του 41χρονου παλαίμαχου ποδοσφαιριστή της (2015-2019) ο οποίος υπέγραψε ως το τέλος της σεζόν 2022/2023.
Ο Εμρέ αποδέχθηκε την πρόταση που του έγινε και πέφτει κατευθείαν στα βαθιά μετά από ένα σύντομο χρονικό διάστημα ως υπηρεσιακός στη Φενέρμπαχτσε.
Μετά από οχτώ αγωνιστικές στο πρωτάθλημα Τουρκίας η Μπασακσεχίρ είναι στη 16η θέση με συγκομιδή 6 βαθμών και βρίσκεται εκτός επικίνδυνης ζώνης λόγω ισοβαθμίας.